اختلفت الآراء حول أسباب تسمية الجامع الأزهر، وهو ما بيَّنه الأزهر الشريف من خلال الصفحة الرسمية على موقع "فيسبوك".   وذكرت الصفحة في صورة تحمل عنوان «الأزهر في العصر الفاطمي»، نقلًا عن "أخبار اليوم"، أن المؤرخين اختلفوا في سبب تسمية الجامع الأزهر، فقيل إن التسمية نسبة إلى السيدة فاطمة الزهراء، وهو الأرجح بحسب صفحة الأزهر، وقيل نسبة للقصور الزاهرة الفخمة التي كانت تحيط به، وقيل هو من قبيل التفاؤل بما سيبلغه هذا المسجد من ازدهار العلوم فيه، وأنه سيكون أعظم المساجد ضياءً ونورًا.